La Saône doit son nom à la nation celte des Séquanes et à la déesse tutélaire Souconna ou Sauc-Onna. De ses trois noms, Brigoulus, Souconna et Arar, finalement, Souconna lui est resté, que les moines copistes ont progressivement renommé saoconna, d’où elle tire son nom de Saône.

Son ancien nom avant le monde romain était Arar. Il est le doublement de la racine indo-européenne ar = eau, car, s’écoulant lentement, il est difficile parfois de deviner son sens (selon César, dans La Guerre des Gaules). Son nom actuel vient d’une source sacrée, Sauc-Onna, située à Chalon, dont le nom fut donné à l’ensemble de la rivière par les légionnaires romains